Les organes d’administration et de gestion de Maroc Citrus sont :
L’Assemblée Générale constitué de 51 membres représentant toutes les composantes de la filière agrumicole : ASPAM (15), AMAPAC (2), ASCAM (15), AMITAG (2) et Citrus Export (17).
Le Conseil d’Administration composé de 24 membres représentant également tous les maillons de la filière: ASPAM (7), AMAPAC (1), ASCAM (7), AMITAG (1) et Citrus Export (8).
Le Bureau composé de 13 membres et chargé d’assister le Président dans ses fonctions.
Maroc Citrus est dotée d’une Direction chargée de la gestion des dossiers de cette interprofession et du suivi de la mise en œuvre de son plan d’actions arrêté par le Conseil d’Administration.